科研服務(wù)
單細胞5’轉(zhuǎn)錄組測序+免疫組庫測序
產(chǎn)品簡介
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是一種在單個細胞水平，一次性實現(xiàn)對幾百到幾萬個細胞的mRNA進行高通量測序的技術(shù)。單細胞5' 轉(zhuǎn)錄組測序主要是通過捕獲序列末端的TSO結(jié)構(gòu)，捕獲mRNA 5' 末端的序列進行高通量測序。它通常能捕獲到靠近5' 端的免疫組V(D)J基因和一些未經(jīng)加工的RNA，可用于探索免疫細胞的表達譜和多樣性、RNA起始位點和轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制。
單細胞5’轉(zhuǎn)錄組+免疫組庫聯(lián)合測序，可以高通量的檢測單個細胞中5’mRNA表達以及全長TCR/BCR多樣性信息。既可以通過單細胞轉(zhuǎn)錄組信息發(fā)現(xiàn)一塊組織內(nèi)細胞的異質(zhì)性，還可以通過檢測TCR和BCR的克隆型來了解不同狀態(tài)下生物體的免疫系統(tǒng)組成，輔助自身免疫病、炎癥、感染性疾病、腫瘤免疫等研究，加速了對機體免疫系統(tǒng)的理解。
單細胞5’轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品凝膠珠構(gòu)成
單細胞免疫組庫測序技術(shù)流程
服務(wù)流程
高通量單細胞測序服務(wù)流程
結(jié)果展示
單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
細胞分群圖（左1）； 細胞亞群特定基因表達熱圖（左2）； 擬時間序列分析（右1）； 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析（右2）
單細胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析
V(D)J基因組合（左1）； V(D)J基因使用頻率統(tǒng)計（左2）； B細胞克隆型注釋（右1）； 多樣本比較分析（右2）
單細胞轉(zhuǎn)錄組與單細胞免疫組庫聯(lián)合分析
基于克隆型信息重建細胞亞群（左）； TCR在表達譜的映射（右）
產(chǎn)品優(yōu)勢
超高通量
單次實驗可以對上萬個細胞進行高通量分離、標記；
高捕獲率
每個樣本捕獲效率高達65%，高效捕獲每個細胞中的基因表達信息；
高性價比
與低通量或傳統(tǒng)人工操作等方法相比，成本降低數(shù)十倍；
廣泛應(yīng)用
對細胞類型無限制，已廣泛應(yīng)用于識別細胞周期、腫瘤細胞異質(zhì)性、鑒定罕見細胞類型、免疫細胞分析、疾病分型等領(lǐng)域；
經(jīng)驗豐富
百奧益康技術(shù)團隊現(xiàn)已累積150余種不同組織類型、10,000+個樣品的單細胞測序經(jīng)驗。
應(yīng)用方向
腫瘤免疫 感染性疾病 自身免疫病 免疫系統(tǒng)發(fā)育與分化
移植和免疫重塑 炎癥反應(yīng) 疫苗和抗體 生物標記物
支持平臺
10x Genomics Chromium Controller單細胞平臺
10x Genomics Chromium X單細胞平臺
應(yīng)用案例
兒童白血病中與持久性CD19 CAR-T細胞相關(guān)的轉(zhuǎn)錄特征
Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia.
發(fā)表雜志：Nature Medicine（IF：82.90）
發(fā)表時間：2023年7月
應(yīng)用技術(shù)：單細胞轉(zhuǎn)錄組測序、免疫組庫測序
CAR-T細胞療法已被證明在治療血液系統(tǒng)惡性腫瘤中具有顯著療效。然而，不同患者對CAR-T細胞治療的反應(yīng)存在差異。此文章的研究團隊使用scRNA-seq，scTCR-seq等技術(shù)，對10例復(fù)發(fā)難治性兒童急性B淋巴細胞白血病（relapsed and refractory childhood pre-B cell acute lymphoblastic leukemia，R/R B-ALL）患者接受CD19 CAR-T細胞治療后5年內(nèi)的血液和骨髓樣本進行了深入的分析。發(fā)現(xiàn)長壽命CAR-T細胞具有CD4/CD8雙陰性表型和疲勞樣記憶狀態(tài)，并具有獨特的轉(zhuǎn)錄特征。這種持久性特征在所有長期治療反應(yīng)良好的兒童中占主導地位，并在兩名慢性淋巴細胞白血病成年患者中檢測到。這些發(fā)現(xiàn)提出了一種可能性，即臨床有效的、持久的CD19 CAR-T細胞存在通用的轉(zhuǎn)錄特征。
