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單細胞3’轉(zhuǎn)錄組測序
產(chǎn)品簡介
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是一種在單個細胞水平，一次性實現(xiàn)對幾百到幾萬個細胞的mRNA進行高通量測序的技術。單細胞3' 轉(zhuǎn)錄組測序主要是通過捕獲序列末端的poly(dT)結(jié)構(gòu)，捕獲mRNA 3' 末端的序列進行高通量測序，通常捕獲到的是成熟RNA或者已經(jīng)被Polymerase II進行加工的RNA，因此可以更好地反映RNA的穩(wěn)定性和表達水平。隨著單細胞測序技術的不斷更新和發(fā)展，其在解析細胞異質(zhì)性，揭示微環(huán)境中細胞群體間的關系，追蹤疾病發(fā)生發(fā)展等研究中將發(fā)揮越來越重要的作用，后續(xù)可為個性化預防、治療提供技術支持。
單細胞測序和傳統(tǒng)測序的區(qū)別
服務流程
高通量單細胞測序服務流程
支持平臺
百奧益康CelCode®單細胞平臺
10x Genomics Chromium Controller單細胞平臺
10x Genomics Chromium X單細胞平臺
結(jié)果展示
細胞聚類分析
細胞分群圖（左1）； 亞群Marker基因注釋（左2）； 細胞亞群特征基因聚類熱圖（右1）； 小提琴圖（右2）
功能富集分析
GO 富集分析（左1）； KEGG富集分析（左2）； GSEA富集分析（右1）； 蛋白互作網(wǎng)絡分析（右2）
細胞軌跡分析
基因表達擬時間分析（左）； RNA Velocity 分析（右）
細胞互作分析
細胞互作圖（左1）； 基因表達相關性關聯(lián)圖（左2）； Cluster 間的互作關系網(wǎng)（右1）； 配體受體互作分析（右2）
產(chǎn)品優(yōu)勢
超高通量
單次實驗可以對上萬個細胞進行高通量分離、標記；
高捕獲率
每個樣本捕獲效率高達65%，高效捕獲每個細胞中的基因表達信息；
高性價比
與低通量或傳統(tǒng)人工操作等方法相比，成本降低數(shù)十倍；
廣泛應用
對細胞類型無限制，已廣泛應用于識別細胞周期、腫瘤細胞異質(zhì)性、鑒定罕見細胞類型、免疫細胞分析、疾病分型等領域；
經(jīng)驗豐富
百奧益康技術團隊現(xiàn)已累積150余種不同組織類型、10,000+個樣品的單細胞測序經(jīng)驗。
應用方向
1.人類細胞圖譜構(gòu)建 2.腫瘤異質(zhì)性研究 3.干細胞發(fā)育以及分化
4.免疫反應研究 5.神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育研究 6.器官發(fā)育研究
應用案例
人類大腦發(fā)育早期的綜合細胞圖譜
Comprehensive cell atlas of the first-trimester developing human brain
發(fā)表雜志：Science（IF：56.9）
發(fā)表時間：2023年10月
應用技術：單細胞轉(zhuǎn)錄組測序、空間轉(zhuǎn)錄組測序、原位測序
成年人的大腦由一千多種不同的神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)細胞組成，這種多樣性在大腦發(fā)育早期就已經(jīng)出現(xiàn)。為了精準地揭示大腦早期發(fā)育機制，本研究機制單細胞RNA測序和空間轉(zhuǎn)錄組學技術，揭示了人類大腦在懷孕后5至14周（pcw）的細胞狀態(tài)和軌跡。鑒定出12個主要細胞類型，大約600種不同的細胞狀態(tài)，對5 pcw的樣本進行精確的空間解剖域。詳細描述了人類前腦和中腦的分化軌跡，并發(fā)現(xiàn)大量區(qū)域特異性膠質(zhì)母細胞成熟為不同的前星形膠質(zhì)細胞和前少突膠質(zhì)細胞前體細胞。該研究揭示了在人類大腦發(fā)育的前三個月細胞類型的建立，為解釋許多區(qū)域特異性發(fā)生模式或嚴重的腦部疾病以及確定影響特定腦細胞群的人類疾病的治療靶點提供了豐富的資源。
研究結(jié)果概述
細胞分群圖