科研服務
mRNA測序
產品簡介
轉錄組測序是通過高通量測序技術全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息，包括編碼RNA和非編碼RNA，結合生物信息技術獲得RNA的表達和調控信息，檢測多種RNA的表達和變化，同時建立不同類型的非編碼RNA與mRNA之間的調控關系，探索RNA之間的相互作用，構建潛在的RNA調控網絡，系統的揭示生物現象背后RNA世界的轉錄調控規律。
技術路線圖
結果展示
基因表達量小提琴圖（左）； 樣本相關性圖（中）； 差異表達基因火山圖（右）
差異基因在染色體上的分布圖（左）； 差異表達模式聚類圖（中）； circRNA-miRNA-mRNA網絡圖（右）
送樣要求
應用方向
應用案例
全轉錄組測序和蛋白組共同揭示心力衰竭關鍵表達分子和蛋白靶點
Fibroblast-specific proteotranscriptomes reveal distinct fibrotic signatures of human sinoatrial node in nonfailing and failing hearts
發表雜志：Circulation（IF: 29.690）； 發表時間： 2021年 7月； 應用技術： 全轉錄組測序
本研究采用從右心房和竇房結分離的成纖維細胞，經體外培養后進行全轉錄組測序和定量蛋白組，繪制包括信使RNA、非編碼RNA（lncRNA和miRNA）和蛋白質在內的全面轉錄-蛋白組表達圖譜。全轉錄組測序分析，發現正常心臟和衰竭心臟中竇房結組織成纖維細胞的mRNA整體表達模式相似，表明二者有共同的信號通路和分子機制。正常心臟竇房結和右心房分離培養的成纖維細胞具有樣本特異性的差異。另外，本研究還是首次記錄人類竇房結組織成纖維細胞所特有的長鏈非編碼lncRNA。在加入TGF-β的組別比較中，miRNA在正常心臟和衰竭心臟中竇房結組織中呈現出明顯差別的表達模式。這項研究通過分子和蛋白質靶點綜合圖譜，建立人心臟竇房結成纖維細胞蛋白-全轉錄組數據庫。這些數據可用于識別分子和蛋白質的特征、信號通路，以及心衰患者竇房結纖維化和心律失常的潛在治療靶點。
竇房結成纖維細胞全轉錄組表達譜組成（左）； 促纖維化相關的差異表達的mRNA基因（右）
lncRNA差異表達層次聚類熱圖分析（左）； miRNA表達差異表達層次聚類熱圖（右）